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基因檢測(cè)解碼“生命說明書”全球競跑基因數(shù)據(jù)庫

基因

隨著華大基因上市臨近,基因檢測(cè)概念再度被關(guān)注。

華大基因CEO尹燁曾在公開場(chǎng)合介紹,給基因?qū)W家一滴血,能查到生育、腫瘤、感染,從三檢合一到N檢合一,液體活檢可以做更多的事情。

相比于傳統(tǒng)的影像學(xué)檢測(cè)手段只能檢測(cè)出已經(jīng)發(fā)生且長成一定大小的異物,基因檢測(cè)技術(shù)的優(yōu)勢(shì)在于,在更早的發(fā)病初始期,從分子水平進(jìn)行檢測(cè)以及提前預(yù)防和采取措施,這也被視作精準(zhǔn)醫(yī)療的一大基礎(chǔ)。

在中國,基因檢測(cè)行業(yè)也正在經(jīng)歷高速增長期。深圳市基因與抗體治療重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室主任黃來強(qiáng)告訴21世紀(jì)經(jīng)濟(jì)報(bào)道記者,中國的人口數(shù)量世界第一,隨著國民經(jīng)濟(jì)的快速增長,基因檢測(cè)在中國的商業(yè)化勢(shì)頭更猛。

據(jù)Markets and markets預(yù)測(cè),中國的基因測(cè)序產(chǎn)業(yè)2012-2017年間復(fù)合年均增長率將達(dá)到20%-25%。

在應(yīng)用之外,放在國際產(chǎn)業(yè)競爭的層面來看,中國基因檢測(cè)的發(fā)展需要真正走向價(jià)值鏈高端,一方面,從產(chǎn)業(yè)鏈的角度,企業(yè)在試圖打破上游測(cè)序儀設(shè)備的壟斷局面,另一方面,在壁壘較高的數(shù)據(jù)庫建立方面,中國也正在加緊布局。

價(jià)格下降“超摩爾定律”

通過基因檢測(cè)預(yù)知未出生胎兒的健康,是很多普通大眾了解這一醫(yī)學(xué)手段的途徑。

業(yè)內(nèi)人士指出,應(yīng)用落地最為成熟的正是無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測(cè)(Non-invasive Prenatal Testing,以下簡稱NIPT)。

2014年2月,國家食品藥品監(jiān)督管理總局和衛(wèi)計(jì)委一度叫停了無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測(cè)項(xiàng)目,但不久后,基因檢測(cè)臨床應(yīng)用試點(diǎn)被陸續(xù)放開,監(jiān)管從趨嚴(yán)轉(zhuǎn)向?qū)捤伞?/p>

政策的松綁直接促使了行業(yè)的爆發(fā),從華大基因的業(yè)績構(gòu)成可見一斑。據(jù)其招股說明書披露,2016年,生育健康類服務(wù)占其主營業(yè)務(wù)收入的比重達(dá)到54.62%,而2014年的這一比例僅有31.71%。

據(jù)不完全統(tǒng)計(jì),截至2016年底,共有6個(gè)地方政府對(duì)NIPT進(jìn)行了定價(jià)。在部分地區(qū)做這項(xiàng)檢測(cè)還可以獲得政府補(bǔ)貼,未來還有進(jìn)一步的降價(jià)空間。

在計(jì)算機(jī)領(lǐng)域存在著“摩爾定律”,即微處理器的性能每隔18個(gè)月提高一倍,而價(jià)格下降一半?;驕y(cè)序的價(jià)格,則被視作以“超摩爾定律”的規(guī)律急速下降。第一代測(cè)序儀基因組測(cè)序成本大約為1000萬美元,到2013年Illumina推出HiSeq X Ten,將全基因組測(cè)序價(jià)格下降到1000美元以下。

松禾創(chuàng)新投資總監(jiān)王陽告訴21世紀(jì)經(jīng)濟(jì)報(bào)道記者,在基因檢測(cè)的市場(chǎng)培育過程中,價(jià)格越低,民眾的接受度將會(huì)越高。

尹燁也曾指出,如果一個(gè)人的基因組檢測(cè)是一臺(tái)智能手機(jī)的價(jià)錢,但它是指導(dǎo)每個(gè)人生命的說明書,你會(huì)不會(huì)消費(fèi)?

擺脫測(cè)序工具掣肘

但在基因檢測(cè)產(chǎn)業(yè)鏈上游的測(cè)序儀領(lǐng)域,中國僅稱得上剛起步。目前,最穩(wěn)定、應(yīng)用最廣的第二代基因檢測(cè)儀器市場(chǎng)被國外幾個(gè)龍頭所壟斷,2015年,Illumina,Inc.、Life Technologies和Pacific Biosciences共占據(jù)了全球94%的份額。

此外,應(yīng)用商還必須購買測(cè)試儀器運(yùn)行所需的耗材和試劑。華大基因的招股說明書披露,公司最近三年直接材料費(fèi)用占主營業(yè)務(wù)成本的比例分別為50.47%、54.13%和51.93%,其中主要物料支出為測(cè)序試劑。

對(duì)于中國而言,走向產(chǎn)業(yè)鏈上游,擺脫測(cè)序工具受制于供應(yīng)商的局面成為中國企業(yè)的一大愿景。尹燁指出,中國摸索了很多年,但科技背后的難度往往被低估。

2013年,華大反向收購了美國的測(cè)序儀上市公司Complete Genomics,從而擁有了自主產(chǎn)權(quán)的DNA 測(cè)序儀。2014年,華大基因的BGISEQ-1000、BGISEQ-100測(cè)序儀獲得批準(zhǔn)。此后,達(dá)安基因、博奧生物、貝瑞和康等公司也均有測(cè)序儀獲批。

自主產(chǎn)權(quán)的測(cè)序儀也被列入了國家級(jí)的產(chǎn)業(yè)規(guī)劃。2015年,國家發(fā)改委發(fā)布的《關(guān)于實(shí)施新興產(chǎn)業(yè)重大工程包的通知》提出,引導(dǎo)骨干企業(yè),通過上下游聯(lián)動(dòng)、協(xié)同,推進(jìn)具有我國自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的基因檢測(cè)儀器設(shè)備及試劑的產(chǎn)業(yè)化應(yīng)用。

王陽告訴記者,基因測(cè)序儀的生產(chǎn)制造受更上游的精密儀器、光學(xué)成像等技術(shù)制約,中國跟發(fā)達(dá)國家還存在很大的差距,追趕并不是一件簡單的事情。但測(cè)序儀未來的一個(gè)方向?qū)⑹潜M量實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化流程,減少人工操作,“國內(nèi)外的公司都在朝這個(gè)方向努力”。

中國人的“基線”數(shù)據(jù)庫

基因測(cè)序?yàn)閭€(gè)體提供連續(xù)的基因大數(shù)據(jù),是精準(zhǔn)醫(yī)療的基礎(chǔ)和實(shí)現(xiàn)途徑。

2015年1月,美國發(fā)布以基因檢測(cè)為主的“精準(zhǔn)醫(yī)療”計(jì)劃,這一概念迅速成為醫(yī)學(xué)界的熱詞。同年3月,中國的衛(wèi)計(jì)委和科技部先后召開精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)戰(zhàn)略專家會(huì)議,擬到2030年前,合計(jì)投入600億人民幣,開展“精準(zhǔn)醫(yī)療”。

黃來強(qiáng)告訴記者,美國的精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)計(jì)劃所設(shè)定的首要目標(biāo)是在癌癥診斷治療方面實(shí)現(xiàn)突破。而精準(zhǔn)醫(yī)療的長遠(yuǎn)目的,是擴(kuò)展到疾病風(fēng)險(xiǎn)的預(yù)測(cè)評(píng)估、環(huán)境因素和生活方式的影響等全面的健康管理。

華大基因董事長汪建則曾對(duì)媒體表示,在基因工程領(lǐng)域,最大的挑戰(zhàn)是數(shù)據(jù)庫的問題。

具體而言,僅僅靠基因檢測(cè)、觀察手段,遠(yuǎn)遠(yuǎn)不足以稱為精準(zhǔn)醫(yī)療,檢測(cè)結(jié)果的解讀更倚賴長期、大樣本量的數(shù)據(jù)庫。

王陽告訴記者,數(shù)據(jù)庫包含影像數(shù)據(jù)、檢測(cè)、臨床治療、用藥前后的數(shù)據(jù)等等,這些全部加起來建立健康譜,才能真正對(duì)健康情況進(jìn)行預(yù)測(cè)或是臨床指導(dǎo)。

2006年,國際腫瘤基因組協(xié)作組啟動(dòng)“癌癥基因組圖集”計(jì)劃,旨在繪制出1萬個(gè)腫瘤基因組景觀圖譜,到2015年宣告完成時(shí),科學(xué)家們發(fā)現(xiàn)了近1000萬個(gè)癌癥相關(guān)突變。

2014年,華大基因也聯(lián)結(jié)全球產(chǎn)學(xué)研合作伙伴啟動(dòng)了“十萬腫瘤科研計(jì)劃”和“萬人腫瘤‘基線’研究計(jì)劃”。

時(shí)任華大醫(yī)學(xué)執(zhí)行副總裁易鑫介紹,“萬人腫瘤‘基線’研究計(jì)劃”將測(cè)定10000人的腫瘤相關(guān)基因突變、蛋白標(biāo)記物、免疫系統(tǒng)多樣性等指標(biāo),通過比較不同性別、年齡段健康人群和已確診的癌癥早期、中晚期人群之間的各項(xiàng)指標(biāo)變化,劃出健康人群和腫瘤患者之間在基因變化指標(biāo)上的“分水嶺”,構(gòu)建中國人群癌癥早期發(fā)病的腫瘤“基線數(shù)據(jù)庫”。

基因庫國際競跑

在明確“基線”的基礎(chǔ)上,分析參與者的腫瘤發(fā)生相關(guān)指標(biāo),一旦發(fā)現(xiàn)參與者的指標(biāo)偏離“基線”,可以盡早發(fā)現(xiàn)可導(dǎo)致腫瘤的變化,改善腫瘤的診斷、治療以及預(yù)防。

醫(yī)健創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)大數(shù)據(jù)平臺(tái)火石創(chuàng)造的首席分析師苗先鋒告訴21世紀(jì)經(jīng)濟(jì)報(bào)道記者,在腫瘤基因檢測(cè)領(lǐng)域,目前運(yùn)用最廣泛的是個(gè)性化用藥指導(dǎo)(伴隨診斷),但很多情況下,基因跟疾病之間到底存在怎樣的關(guān)系,在基礎(chǔ)科學(xué)層面尚不清楚。

2016年9月,由華大基因承建和運(yùn)營的國家基因庫正式投入運(yùn)行。21世紀(jì)經(jīng)濟(jì)報(bào)道記者從國家基因庫獲得的數(shù)據(jù)顯示,目前已初步建成的數(shù)據(jù)庫有40多個(gè),包括中國腫瘤基因組(ICGC)數(shù)據(jù)庫、癌癥數(shù)據(jù)庫等,其中ICGC現(xiàn)已收集70個(gè)癌癥研究項(xiàng)目。

盡管基因庫的設(shè)立時(shí)間晚于美國、歐洲、日本十?dāng)?shù)年,但苗先鋒告訴記者,不管是從政策還是資金方面,中國對(duì)基因數(shù)據(jù)庫的重視程度越來越高?!盎蛞呀?jīng)是一種國家級(jí)的戰(zhàn)略性資源。”

企業(yè)也并未缺席。2015年7月,基因檢測(cè)創(chuàng)業(yè)公司海普洛斯攜手深圳市人民醫(yī)院聯(lián)合啟動(dòng)“萬人癌癥基因測(cè)序計(jì)劃”,其一大目的也正是為建立大型癌癥基因數(shù)據(jù)庫。

王陽表示,在單病種的數(shù)據(jù)庫建設(shè)上,每一家企業(yè)都可能成為細(xì)分領(lǐng)域的領(lǐng)先者。

(編輯:耿雁冰,如有意見建議請(qǐng)聯(lián)系:wangfan@21jingji.com;gengyb@21jingji.com)

責(zé)任編輯:海凡

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